中国军队于中华民国初期开始编设这一职务。

中国人民解放军的战区、省军区、卫戍区、警备区、守备区、要塞区、基地、军分区，陆军、战区陆军，海军、舰队、水警区，空军、战区空军，火箭军、战略支援部队等单位设司令员。

各级司令员与同级政治委员均为该部队主官，按照党委集体领导下的首长分工负责制原则，在上级中国共产党委员会、首长和同级党委领导下，负责领导部队的作战、训练和管理等工作。

中国人民武装警察部队也设有司令员。