方震孺于明万历四十一年（公元1613年）进士。初任沙县知县，后为御史。明熹宗朱由校嗣位，太监大头目魏忠贤勾结朱由校乳母客氏，结党擅政，欺压臣僚，扰乱朝纲。方震孺上疏朝廷，劝告皇帝：宫妾、近侍之流极不可靠，不要轻易信赖他们，不要给他们实权，否则必有隐祸。天启元年（1621年），中官（太监）张晔、刘朝被讼。魏忠贤心怯，欲暗中结好于方震孺，方震孺拒其所请。由此，魏忠贤怀恨在心。

后金攻破辽东，方震孺一日十三次上疏，请增巡抚，通海运，调边兵，易司马，援助东北。一日五鼓挝公卿门，筹划方略，痛哭流涕，自请赴前方犒师。是时，三岔河以西军民逃散，人烟灭绝，文武将吏无一人敢去，帝壮其言，发帑金二十万，命方震孺往前线犒军。方震孺奉旨出关，逐个会见有功将士，吊死问伤，使前方军民人心大悦。方震孺仔细考察了当地的地理状况，向朝廷作了汇报，明熹宗命他巡按辽东，监纪军事。方震孺驻守辽东，居无庐，食无火，治逃兵，拒强敌，艰苦卓绝，任满之际，他在广宁前屯卫等候交接，恰逢后金攻陷广宁卫，巡抚王化贞等官仓皇逃走，只有他在广宁前屯卫岿然不动，并招抚败将祖大寿。魏忠贤却指使同党徐大化诬告方震孺“攘差”，都御史邹元标为之力争，结果方、邹皆被罢官。翌年，魏党又兴大狱，公开招募诬告方震孺的人，遂逮方震孺下狱，坐以贪赃罪，拟处绞刑。崇祯皇帝嗣位，释方震孺归居寿州。