1994年10月16日，昌都邦达机场通过行业验收。

1995年4月28日，昌都邦达机场投入使用，正式开通民航业务，首条航线为中国国际航空使用波音B757-200执飞的成都航线。

2007年8月8月，国家发改委、中国人民解放军总参谋部批复同意昌都邦达机场改扩建工程项目建议书。

2008年5月17日，昌都邦达机场改扩建工程正式开工。

2009年9月25日，昌都邦达机场改扩建工程正式交付使用。

2012年5月3日，昌都邦达机场开通由西藏航空执飞的拉萨航线，结束单一航司运营历史。

2015年10月15日，昌都邦达机场因跑道破损日益严重，飞行区设施设备不能满足行业需求，昌都邦达机场飞行区改扩建工程启动。

2017年10月28日，昌都邦达机场第二跑道交付使用，5000米长的老跑道改为军航跑道，飞行区指标4D变更为4C。

2019年，昌都邦达机场启动航站区改扩建工程。

昌都邦达机场航站楼面积5018.32平方米，设1座登机廊桥；航站楼内部设有航显、广播、供氧、监控、安检信息和离岗等13个系统，满足高峰小时418人次的吞吐量容量；可满足年旅客吞吐量30万人次、货邮吞吐量2200吨的使用需求。

昌都邦达机场飞行区指标为4C，民航站坪设4个机位（2C2D）；第二跑道编号为14/32，长4500米，宽45米，道肩宽2.5米，道面等级号PCN 58/R/B/W/T；跑道两端设置有掉头坪，中间距离新跑道西北端2410米和2760米处各设置有一条垂直联络道与老跑道相连接，宽度18米；跑道设置有中线及边灯，主降方向设置为I类精密进近灯光系统，次降方向设置为B型简易灯光系统，可满足B737-700、A319同类及其以下机型使用要求。

2023年夏秋航季，昌都邦达机场共有3家航司在此开通7条航线，通航4座城市的5座机场

据2020年4月机场官网显示，昌都邦达机场值机柜台分布在航站楼一楼中部，4个值机柜台，其中4号柜台为特殊旅客柜台（军人优先、无陪、老弱病残孕、晚到旅客等）。

据2020年4月机场官网显示，昌都邦达机场人工值机柜台在航班起飞前30分钟停止办理值机手续。

昌都邦达机场航站楼内设有贵宾休息室、母婴室、急诊室、吸烟区、60个爱心座椅等便民设施。

昌都邦达机场航站楼设自助值机区，无托运行李的旅客可在自助值机设备上进行自助办理值机手续，获取电子登机牌；操作流程如下：

1、点击首页“进入”按钮。

2、在证件号码栏目输入您购票时的有效证件号码和个人信息。中华人民共和国颁发的二代身份证和护照可以直接在自助值机设备机上相应位置直接扫描。

3、当输入完证件信息后，屏幕会显示航班信息。点击“确认”后，自助值机系统将进入航班座位选择界面，显示白色的座位为可选座位，可根据喜好选择可选的座位，座位选择完毕后按“下一步”即可打印登机牌。

4、座位选择完毕后，若是常旅客，则可以返回上一页手工输入个人常旅客卡号，进行积分累积。

5、未打印电子客票行程单的旅客可在操作界面中点击“打印行程单”按钮进行打印。

昌都邦达机场航站楼设有“军人依法优先”安检通道，并在通道口张贴了比较明显的“军人依法优先”标识和在待检区加派维序检查员具体负责引导服务和法规解释工作。

昌都邦达机场机场专线由昌都市马草坝民航基地发车（夏季：每天下午18:00，冬季：每天下午16:00），旅客班车票价为60元/人次。

昌都邦达机场有停车场面积为4780平方米，进出口各一个，小型车位约180个；收费为5元一次，20元过夜。

2019年，昌都邦达机场启动航站区改扩建工程，工程规模为：扩建航站楼面积为12000平方米，为两层式航站楼；扩建站坪机位5个，按4C布置；修建吉塘镇基地，新建旅客过夜用房等，工程总投资129958.59万元。

昌都邦达机场是世界上离市区“最远”的民用机场之一，距昌都市区126千米；昌都邦达机场是世界上气候“最恶劣”的民用机场之一，冬季风速达30米/秒以上，极端温度达零下42摄氏度、冻土层厚2米，空气密度仅为海平面的50%；昌都邦达机场有世界上“最长”的跑道之一，其老跑道长达5500米，现用跑道长4500米。

依据国际民航组织（ICAO）292号通告研究结果换算得出（旅客吞吐量按1:10的比例换算货邮吞吐量），2019年昌都邦达机场共推动中国经济增长约9.2亿元人民币，直接带动当地就业约1772人。