1995年-2000年，在北京医科大学工作，先后担任副校长兼研究生院院长、心血管基础研究所所长。

1997年，当选为中国科学院院士；同年担任九三学社北京市副主委。

2000年-2002年，担任九三学社中央副主席、北京大学常务副校长、研究生院院长、医学部主任、心血管研究所所长、生物医学跨学科研究中心主任。

2001年，担任中国科学技术协会副主席。

2002年-2003年，担任九三学社中央主席（2002年12月按部长级待遇），中国科学技术协会副主席，北京大学常务副校长。

2003年-2006年，担任第十届全国人大常委会副委员长，九三学社中央主席，中国科学技术协会副主席，北京大学医学部主任。

2004年，当选发展中国家科学院院士。

2006年-2008年，担任第十届全国人大常委会副委员长，九三学社中央主席，中国科学技术协会主席，欧美同学会·中国留学人员联谊会会长，北京大学医学部主任。

2008年-2013年，担任第十一届全国人大常委会副委员长，九三学社中央主席，中国科学技术协会主席，欧美同学会·中国留学人员联谊会会长，中国红十字会名誉副会长，北京大学医学部主任。

2013年-2016年，担任第十二届全国政协副主席，九三学社中央主席，中国科学技术协会主席，欧美同学会·中国留学人员联谊会会长，中国红十字会名誉副会长，北京大学医学部主任。

2016年，担任第十二届全国政协副主席，九三学社中央主席，中国科学技术协会名誉主席，欧美同学会·中国留学人员联谊会会长，中国红十字会名誉副会长。

2018年12月，入选“中国改革开放海归40年40人”榜单。

2020年5月30日，发起成立科学和医学公共传播基石奖。

2023年9月，任九三学社中央书画院院长。

九三学社第十二次全国代表大会提名代表。

韩启德在国际上首先证实a1肾上腺素受体（a1-AR）包含a1A与a1B两种亚型的假说，并深入研究了各种亚型a1-AR在心脏和血管的分布、介导的效应、调节特征、与-AR的交互作用以及多种病理状况下的改变等，揭示了多种亚型a1-AR在心血管同时存在的生理与病理生理意义。在心血管神经肽研究方面发现血浆和血小板中神经肽Y的改变与脑血管痉挛和高血压的发病有关。并与同事合作在国际上首先提出降钙素基因相关肽为神经－免疫系统间共用信息分子的假说。

韩启德发表学术论文200余篇，据不完全统计，发表的论文被SCI收录刊物引用1700余次。

韩启德，大白鼠实验性心肌梗死时梗死范围和左室心肌收缩性能指标的测定及其特点，西安医学院学报，1982，3：600～604。

韩启德，植物神经系统在心肌梗死中的作用，生理科学进展，1983，14：31～36。

韩启德、席与萍，山莨菪碱对缺血心肌超微结构改变的影响，北京医学院学报，1985，17：101～103。

Han C, Abel P W, Minneman K P, α1-Adrenoceptor Subtypes Linked to Different Mechanisms for Increasing Intracellular Ca2+ in Smooth Muscle, Nature, 1987, Sep 24~30；329（6137）:333~335

Han C, Abel P W, Neuropeptide Y Potentiates Contraction and Inhibits Relaxation of Rabbit Coronary Arteries, J Cardiovasc Pharmacol, 1987, 9: 675~681

Han C, Abel P W, Minneman K P, Hetrogeneity of α1adrenergic Receptors Revealed by Chlorethylclonidine, Mol Pharmacol, 1987, 32: 505~510

Han C, Wang X, Fiscus R R, et al, Changes in Cardiac Neuropeptide Y after Myocardial Infarction in Rat, Neurosci Lett., 1989, 104: 141~146

韩启德、吴皎辉、陈明哲，大鼠心脏中的α1肾上腺素受体存在两种亚型，科学通报，1990，35：1425～1427。

韩启德、吴皎辉、杨丽华等，自发性高血压大鼠心脏α1肾上腺素受体及其亚型的改变，北京医科大学学报，1990，22：417～419。

Han C, Minneman K P, Interaction of Subtype-selective Antagonists with α1-adrenergic Receptor Binding Sites in Rat Tissues, Molecular Pharmacology, 1991, 40: 531~538

韩启德、李金玲，老年大鼠血管α1肾上腺素受体及其亚型的改变，生理学报，1991，43：22～30。

韩启德、李金玲、陈咏梅，自发性高血压大鼠血管α1肾上腺素受体亚型的改变，生理学报，1992，44：229～236。

Han C, Esbenshade T A, Minneman K P, Subtypes of α1ad-renoceptors in DDT1MF-2 and BC3H-1 Clonal Cell Lines, Eup J Pharmacol, 1992, 226: 141~148

韩启德、陈咏梅，缺氧对α1受体不同亚型血管收缩效应影响的差别，生理学报，1993，45：178～181。

Han C, Minneman K P, 3H—tamsulosin Binding to Cloned α1-ad-renergic Receptorsubtypes Expressed in Human Embryonic Kidney 293 Cells: Antaginist Potencies and Sensitivity to Alkylating Agents, Pharmacological Communication, 1995, 5: 117~126

Han C, Yu G, Zhang Y, et al, Alterations of α1-adrenoceptor Subtypes in the Hearts of Thyroxine-treated Rats, European Journal of Pharmacology, 1995, 294: 593~599

韩启德，两种α1肾上腺素受体亚型的证实、在心血管的分布、功能与病理改变，中国生理学会七十周年纪念学术论文集，237～240。

韩启德，α1肾上腺素受体3种亚型在心血管共存的生理与病理生理意义，北京医科大学学报，1999，31（2）：97～102。

Han Q D, Physiological and Pathophysiological Significance of Co-existence of Three Subtypes of 1-Adrenoceptor in Heart and Blood Vessels, Chinese Medical Journal, 1999, 112(10): 950~955

韩启德认为：科技创新是国家创新驱动发展战略极其重要的组成部分。有效推动中国科技创新，关键在于营造良好的科技创新环境：努力形成以科技创新为发展根本驱动力的导向；充分调动科技人员的创新积极性；大力激发企业的创新活力；加快做强科技服务业；不断提高全民科学素质。

韩启德在北京大学等高等院校讲授《心血管病理生理学》《受体学》等诸门课程。

截至2014年6月，韩启德已培养博士30人，硕士7名，博士后7人。

《医学的温度》（商务印书馆，2020年10月）韩启德院士以“医学的温度”为主题，结集了近些年对医学的本质、医学史、叙事医学、精准医学等的人文思考，阐述了对癌症、传染病、中医、死亡等的独特看法，对癌症应该早发现、早诊断、早治疗等人们习以为常的医学观点提出质疑和建议，对全速发展的现代医学技术及其发展方向进行重新审视，提出应回归以病人为中心的价值医疗、不能忘记医学的来路和归途等观点。该书对人们重新认识现代医学乃至重新认识自我都极具启发意义。

2020年11月，《医学的温度》获评2020商务印书馆人文社科“十大好书”。

韩启德的父亲曾留学日本，在神户商学院攻读经济学。母亲出生于一个没落的官僚家庭，毕业于桑蚕专科学校。他在10岁时，因患猩红热并发严重风湿性关节炎和心包炎，昏迷三天三夜后被抢救过来。这场病使他真在心中默默产生了一个愿望——做一名医生。

韩启德长期从事心血管基础研究，在a1肾上腺素受体（al—AR）研究领域获重要成果，在心血管神经肽研究方面也取得不少创新性成果。（何梁何利基金会评）

我不同意中医是科学。科学是一科一科的学问，现代的学问必须包含要素，必须是可质疑的，不断靠向真理，不断纠错，必须是能实证的、量化的，必须用逻辑学的方法等等，科学的要素，有很多中医是达不到的。中医凭感觉、凭经验，但是有没有经过实证？有。经过两三千年绵延不绝，中华民族繁荣昌盛，大量的病都看好了，这是事实。但它并没有符合科学里面的很多要素。

中医是好的，但不一定是科学的。科学并不在于正确，不科学不说明它不正确，不好。如果硬要把中医跟现代科学去靠，永远使人觉得不如现代科学，跟现代科学没法儿去比。

对科学要有正确的理解，不要把科学跟正确联系起来。科学只是人类文明发展到1500年后，在这几百年里，一部分地球人认定的一种体系。而中医是中华民族几千年来认定的体系，为什么一定要把两个体系去完全等同起来呢？应该有这个自信，也应该吸收互相的长处。中西医结合是非常好的道路，两个体系、两个哲学体系要合在一起谈何容易。

叙事医学要求每一个学生都写出人文病理，除了写疾病规范的病理以外，必须写出病人患病以后的心理、家人的反映、看病过程当中有什么心理活动，自己是怎么沟通的。

现在的西医几乎已经不碰病人了，裘法祖提到一个故事，说一个病人肚子疼，找到他，他让到检查床摸了一下他肚子，这个病人感动得掉眼泪，说你是我看的第六个医生，前面五个医生都没有碰过我一下肚子。西医已经到了完全靠设备，完全靠人为确定的指标来解决问题。尽管有它很好的能解决问题的地方，但离开病人越来越远，容易造成矛盾。中医首先要把脉，医生的手搭到了病人的手，再加上一个笑容，病人的感觉跟我等了几个小时，看到医生头都不抬，化验单一开检查去，感觉很不一样。

中医不会这样，我当中医，病人刚走进来我就知道他大概是什么问题，在农村时，妇女坐下来给你一个胳膊，什么也不说，我就知道她要我把脉是不是怀孕了。中医的怀孕的脉是很好把的，我学了9个月，掌握的非常好，滑脉就像钢珠子在手底下滑过去，你就问她你月经过去了多长时间？她说我已经有两个月了。恭喜你！你是神医！

医学现在缺乏人文，离人文越来越远，离开它医学的宗旨也有点渐行渐远，这一点特别应该要注意。

人文素养不是上音乐课、艺术课学得到的，人文渗透在人的血液里，大学生要多看小说，看经典的文学著作，包括18、19世纪的外国名著，包括现在中国好的文学作品。